Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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