Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA5O15230 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA5O15230 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA5O15230 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMA5O15230 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAMA5O15230 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAMA5O15230 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAMA5O15230 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA5O15230 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms