Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNMO15061 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNMO15061 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNMO15061 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNMO15061 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNMO15061 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNMO15061 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNMO15061 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms