Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIEO00221 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIEO00221 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms