Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF26H0Y7S4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms