Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms