Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms