Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms