Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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