Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WIPF3A6NGB9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms