Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD3L4A6NDZ8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms