Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms