Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFCAB5A4FU69 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms