Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB4A4D0S4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB4A4D0S4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB4A4D0S4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMB4A4D0S4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms