Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms