Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms