Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms