Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms