Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms