Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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