Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms