Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK2Q9UPX8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms