Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms