Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms