Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMKLBQ9ULI2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMKLBQ9ULI2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms