Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms