Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms