Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF7Q9UBF6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RNF7Q9UBF6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RNF7Q9UBF6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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