Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHRF1Q9P1Y6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms