Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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