Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms