Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms