Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT57Q9NWB7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms