Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC4Q9NTJ3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms