Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms