Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms