Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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