Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms