Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms