Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms