Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms