Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZYG11BQ9C0D3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms