Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms