Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC4A5Q9BY07 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms