Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPATA16Q9BXB7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms