Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms