Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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