Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms