Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms