Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP88Q99567 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms